Covid-19 : entre le 12 et le 18 octobre 2020, plus de la moitié des tests RT-PCR ont été réalisés en moins de 24 heures
Entre le 1er mars et le 18 octobre 2020, on estime que près de 17 723 000 tests RT-PCR ont été réalisés en France : 2 293 000 sur la période du 1er mars au 6 juin (d'après la plateforme de remontée des tests) et 15 430 000 sur la période du 7 juin au 18 octobre (d'après SI-DEP). Le nombre de tests RT-PCR réalisés cette semaine augmente très fortement, avec 1 635 000 tests réalisés entre le 12 octobre et le 18 octobre. La semaine passée, 1 300 000 tests avaient été réalisés.
La semaine dernière, les délais ont été très légèrement affectés par l’augmentation du nombre de tests. Le délai médian de rendu du test est de 1,0 jour sur cette période contre 0,9 la semaine précédente.
Les tests validés entre le 12 et le 18 octobre ont été prélevés moins de 24h auparavant dans 52,4 % des cas et moins de 48h auparavant dans 89 % des cas.
Méthodologie
La DREES exploite les données pseudonymisées du système d’information SI-DEP, qui portent sur l’ensemble des tests RT-PCR réalisés par les laboratoires d’analyse médicale, et comportent des informations à la fois sur les résultats des tests et sur leurs délais de réalisation. Le calcul des délais se fait à partir de la date de prélèvement du test (jour, heure, minute), déclarée par le laboratoire, et de la date d’intégration (jour, heure, minute) du test dans le système d’information, intégration qui doit se faire très rapidement après la validation du test.
Les statistiques présentées portent sur l’ensemble des tests réalisés, en date de validation du résultat. Si une même personne a réalisé successivement deux tests, ces deux tests sont donc comptés. Les données sur le nombre de tests diffèrent de celles publiées par Santé Publique France, en date de prélèvement du test. De plus, les délais ici présentés correspondent aux délais entre la date de prélèvement et la date d’intégration des résultats dans SI-DEP. Cependant, la date d’envoi des résultats aux patients par le laboratoire peut être postérieure à l’intégration des résultats dans SIDEP. Les délais entre date de prélèvement et réception des résultats par les patients pourraient donc être supérieurs à ceux mesurés via SIDEP.
Enfin, entre début mars et début juin 2020, préalablement au déploiement complet de SIDEP, la DREES a mis en place à la demande du centre de crise sanitaire un système d’information permettant de comptabiliser le nombre de tests réalisés en France, à partir des déclarations des sites réalisant les tests (et non les prélèvements comme dans SIDEP).
Dans le cadre de l'exploitation des données SIDEP, la DREES procède à quelques retraitements des données. En particulier, les tests remontés avec un pseudonyme manquant sont supprimés. Dans le cas d'un même test remonté plusieurs fois (mise à jour de certaines informations sur le patient par exemple), la DREES conserve la ligne la plus récente, à l'exception de la date d'intégration dans SIDEP dont on retient la valeur la plus ancienne, assimilée à la date de validation du résultat.
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